Công cụ chuyển đổi PAM sang IPL

IPL (IPLab) là định dạng ảnh khoa học được phát triển bởi Scanalytics (sau được BD Biosciences mua lại) cho phần mềm phân tích ảnh khoa học IPLab, phát hành lần đầu khoảng năm 1988. Định dạng được thiết kế để lưu trữ dữ liệu hình ảnh kính hiển vi và khoa học với độ chính xác và metadata cần thiết cho phân tích định lượng trong nghiên cứu sinh học và y sinh. File IPL hỗ trợ nhiều loại dữ liệu bao gồm số nguyên không dấu 8-bit và 16-bit, số nguyên có dấu 16-bit và giá trị pixel dấu phẩy động 32-bit, thích ứng với các dải động rộng do các kính hiển vi huỳnh quang, camera CCD và các thiết bị tạo ảnh khoa học khác tạo ra. Định dạng xử lý các tập dữ liệu nhiều chiều bao gồm Z-stack (chuỗi tiêu điểm qua mẫu vật), chuỗi time-lapse và các lần thu huỳnh quang nhiều kênh nơi mỗi kênh ghi phát xạ từ một đầu dò huỳnh quang khác nhau. File IPL bao gồm header với kích thước ảnh, loại dữ liệu, số lượng mặt phẳng, hiệu chuẩn không gian (chuyển đổi pixel sang micromet) và metadata thu từ hệ thống kính hiển vi. Một ưu điểm là tính toàn vẹn định lượng: không giống các định dạng ảnh chụp áp dụng hiệu chỉnh gamma, nén hoặc chuyển đổi không gian màu, IPL bảo toàn các giá trị cường độ tuyến tính thô từ đầu dò, đảm bảo các phép đo cường độ huỳnh quang, mật độ quang hoặc đếm hạt thực hiện trên dữ liệu ảnh tương ứng trực tiếp với các đại lượng vật lý đang đo. Vai trò của định dạng trong cộng đồng kính hiển vi là một xem xét thực tế khác: IPLab được sử dụng rộng rãi trong các phòng thí nghiệm sinh học tế bào, khoa học thần kinh và bệnh học suốt thập niên 1990 và 2000, và các tập dữ liệu IPL lưu trữ từ nghiên cứu đã công bố vẫn có giá trị khoa học. File IPL có thể được đọc bởi ImageJ/FIJI, Bio-Formats và ImageMagick.