Conversor de PAM para IPL

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Como converter PAM para IPL

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Escolha ipl ou qualquer outro formato de saída desejado (mais de 200 formatos compatíveis)

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Sobre os formatos

PAM (Portable Arbitrary Map) é um formato de imagem rasterizada adicionado a família Netpbm por volta do ano 2000 por Bryan Henderson, o mantenedor do Netpbm, como uma generalizacao que unifica é estende os formatos originais PBM, PGM e PPM. Enquanto os formatos clássicos do Netpbm lidam cada um com um tipo específico de imagem (PBM para biton, PGM para escala de cinza, PPM para cor), o PAM fornece um único formato que pode representar qualquer combinação de canais, profundidades de bit é tipos de imagem através de um cabecalho ASCII flexível. O cabecalho PAM usá pares de palavra-chave é valor: WIDTH, HEIGHT, DEPTH (número de canais), MAXVAL (valor máximo de amostra, até 65535) é TUPLTYPE (uma string identificando o tipo de imagem — BLACKANDWHITE, GRAYSCALE, RGB, GRAYSCALE_ALPHA, RGB_ALPHA ou tipos personalizados). Após o cabecalho, os dados de pixel são armazenados em binário, com cada amostra ocupando um ou dois bytes dependendo de MAXVAL. A inovação chave do PAM sobre seus predecessores é o suporte nativo a canal alfa: os tupletypes GRAYSCALE_ALPHA (2 canais) é RGB_ALPHA (4 canais) fornecem transparência sem exigir um arquivo de mascara separado, algo que os formatos originais PBM/PGM/PPM não podiam expressar. Uma vantagem é a unificacao de formatos: uma única implementacao de leitura de PAM trata imagens monocromáticas, escala de cinza, cor é com alfa, eliminando a necessidade de analisadores separados para cada variante Netpbm. O mecanismo extensivel TUPLTYPE oferece outra força prática — configurações personalizadas de canais (multiespectral, profundidade + cor ou qualquer arranjo específico de aplicativo) podem ser representadas é rotuladas sem modificar a especificação do formato. O PAM é suportado por ferramentas Netpbm, ImageMagick, GIMP é bibliotecas de programação que processam a família Netpbm.
Desenvolvedor: Bryan Henderson / Netpbm
Lançamento inicial: 2000
IPL (IPLab) é um formato de imagem científica desenvolvido pela Scanalytics (posteriormente adquirida pela BD Biosciences) para seu software de análise de imagem científica IPLab, lancado pela primeira vez por volta de 1988. O formato foi projetado para armazenar dados de microscopia é imagem científica com a precisão é metadados necessários para análise quantitativa em pesquisa biologica é biomedica. Os arquivos IPL suportam múltiplos tipos de dados incluindo inteiros sem sinal de 8 é 16 bits, inteiros com sinal de 16 bits é valores de pixel em ponto flutuante de 32 bits, acomodando às amplas faixas dinamicas produzidas por microscopios de fluorescencia, câmeras CCD é outros instrumentos de imagem científica. O formato lida com conjuntos de dados multidimensionais incluindo pilhas Z (séries focais através de um especime), sequências time-lapse é aquisicoes de fluorescencia multicanal onde cada canal captura emissao de uma sonda fluorescente diferente. Os arquivos IPL incluem um cabecalho com dimensões de imagem, tipo de dado, número de planos, calibracao espacial (conversão de pixels para micrometros) é metadados de aquisicao do sistema de microscopio. Uma vantagem é a integridade quantitativa: diferente de formatos fotográficos que aplicam correção gama, compressão ou transformacoes de espaço de cor, o IPL preserva os valores de intensidade linear brutos do detector, garantindo que medidas de intensidade de fluorescencia, densidade otica ou contagem de particulas realizadas nos dados da imagem correspondam diretamente às quantidades fisicas sendo medidas. O papel do formato na comunidade de microscopia é outra consideracao prática: o IPLab foi amplamente usado em laboratorios de biologia celular, neurociencia é patologia ao longo dos anos 1990 é 2000, e conjuntos de dados IPL arquivados de pesquisas publicadas permanecem cientificamente valiosos. Arquivos IPL podem ser lidos por ImageJ/FIJI, Bio-Formats é ImageMagick.
Desenvolvedor: Scanalytics
Lançamento inicial: 1988