Konwersja PGX do IPL

IPL (IPLab) to format obrazów naukowych opracowany przez Scanalytics (później przejęte przez BD Biosciences) dla ich oprogramowania IPLab do naukowej analizy obrazów, wydanego po raz pierwszy około 1988 roku. Format został zaprojektowany do przechowywania danych z mikroskopii i obrazowania naukowego z precyzją i metadanymi niezbędnymi do analizy ilościowej w badaniach biologicznych i biomedycznych. Pliki IPL obsługują wiele typów danych, w tym 8-bitowe i 16-bitowe liczby całkowite bez znaku, 16-bitowe liczby całkowite ze znakiem oraz 32-bitowe wartości zmiennoprzecinkowe pikseli, dostosowując się do szerokich zakresów dynamicznych generowanych przez mikroskopy fluorescencyjne, kamery CCD i inne naukowe instrumenty obrazujące. Format obsługuje wielowymiarowe zbiory danych, w tym stosy Z (serie ogniskowe przez preparat), sekwencje poklatkowe i wielokanałowe akwizycje fluorescencyjne, gdzie każdy kanał rejestruje emisję z innej sondy fluorescencyjnej. Pliki IPL zawierają nagłówek z wymiarami obrazu, typem danych, liczbą płaszczyzn, kalibracją przestrzenną (przelicznik piksele-na-mikrometry) oraz metadanymi akwizycji z systemu mikroskopowego. Jedną z zalet jest integralność ilościowa: w przeciwieństwie do formatów fotograficznych, które stosują korekcję gamma, kompresję czy transformacje przestrzeni kolorów, IPL zachowuje surowe liniowe wartości intensywności z detektora, zapewniając, że pomiary intensywności fluorescencji, gęstości optycznej czy liczby cząstek dokonywane na danych obrazu odpowiadają bezpośrednio mierzonym wielkościom fizycznym. Rola formatu w społeczności mikroskopowej to kolejna istotna kwestia: IPLab był szeroko używany w laboratoriach biologii komórkowej, neurobiologii i patologii w latach 90. i 2000., a archiwalne zbiory danych IPL z opublikowanych badań zachowują wartość naukową. Pliki IPL mogą być odczytywane przez ImageJ/FIJI, Bio-Formats i ImageMagick.