PGX'ten IPL'ye Dönüştürücü

IPL (IPLab), IPLab bilimsel görüntü analiz yazılımları için Scanalytics (daha sonra BD Biosciences tarafından satın alınmıştır) tarafından geliştirilen ve i̇lk olarak yaklaşık 1988'de yayımlanan bir bilimsel görüntü formatıdır. Format, biyolojik ve biyomedikal araştırmalarda nicel analiz için gereken hassasiyet ve meta verilerle mikroskopi ve bilimsel görüntüleme verilerini saklamak üzere tasarlanmıştır. IPL dosyaları; 8-bit ve 16-bit işaretsiz tam sayılar, 16-bit işaretli tam sayılar ve 32-bit kayan nokta piksel değerleri dahil olmak üzere birden fazla veri türünü destekler; floresan mikroskoplar, CCD kameralar ve diğer bilimsel görüntüleme cihazlarının ürettiği geniş dinamik aralıklara uyum sağlar. Format; Z-yığınları (numune boyunca odak serileri), zaman atlamalı diziler ve her kanalın farklı bir floresan probdan emisyon yakaladığı çok kanallı floresan edinimlerini içeren çok boyutlu veri setlerini işler. IPL dosyaları, görüntü boyutları, veri türü, düzlem sayısı, uzamsal kalibrasyon (pikselden mikrometreye dönüşüm) ve mikroskop sisteminden edinim meta verilerini içeren bir başlık barındırır. Bir avantajı nicel bütünlüktür: gama düzeltmesi, sıkıştırma veya renk uzayı dönüşümü uygulayan fotoğrafik formatların aksine IPL, dedektörden gelen ham doğrusal yoğunluk değerlerini korur ve görüntü verileri üzerinde gerçekleştirilen floresan yoğunluğu, optik yoğunluk veya parçacık sayısı ölçümlerinin doğrudan ölçülen fiziksel büyüklüklere karşılık gelmesini sağlar. Formatın mikroskopi topluluğundaki rolü de pratik bir boyuttur: IPLab, 1990'lar ve 2000'ler boyunca hücre biyolojisi, sinirbilim ve patoloji laboratuvarlarında yaygın olarak kullanılmıştır. IPL dosyaları ImageJ/FIJI, Bio-Formats ve ImageMagick tarafından okunabilir.