PGX를 IPL로 변환

IPL(IPLab)은 Scanalytics(이후 BD Biosciences에 인수)가 1988년경 처음 출시한 IPLab 과학 이미지 분석 소프트웨어를 위해 개발한 과학 이미지 포맷입니다. 이 포맷은 생물학 및 생의학 연구에서 정량 분석에 필요한 정밀도와 메타데이터를 갖춘 현미경 및 과학 이미징 데이터를 저장하도록 설계되었습니다. IPL 파일은 형광 현미경, CCD 카메라 및 기타 과학 이미징 장비가 생성하는 넓은 다이내믹 레인지를 수용하기 위해 8비트 및 16비트 부호 없는 정수, 16비트 부호 있는 정수, 32비트 부동소수점 픽셀 값을 포함한 다양한 데이터 유형을 지원합니다. 이 포맷은 Z-스택(시료를 통한 초점 시리즈), 타임랩스 시퀀스, 각 채널이 다른 형광 프로브의 방출을 캡처하는 다중 채널 형광 획득 등 다차원 데이터셋을 처리합니다. IPL 파일에는 이미지 차원, 데이터 유형, 평면 수, 공간 보정(픽셀-마이크로미터 변환), 현미경 시스템의 획득 메타데이터가 포함된 헤더가 있습니다. 정량적 무결성이 장점 중 하나입니다 — 감마 보정, 압축, 색공간 변환을 적용하는 사진 포맷과 달리 IPL은 검출기의 원시 선형 강도 값을 보존하여, 이미지 데이터에서 수행하는 형광 강도, 광학 밀도, 입자 수 측정이 측정 중인 물리적 양에 직접 대응하도록 보장합니다. 현미경학 커뮤니티에서의 역할도 실용적 고려사항입니다 — IPLab은 1990년대와 2000년대에 걸쳐 세포생물학, 신경과학, 병리학 연구실에서 널리 사용되었으며, 발표된 연구의 보관된 IPL 데이터셋은 여전히 과학적 가치가 있습니다. IPL 파일은 ImageJ/FIJI, Bio-Formats, ImageMagick으로 읽을 수 있습니다.