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フォーマットについて
IPL（IPLab）は、Scanalytics（後にBD Biosciencesに買収）が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック（試料を通過する焦点シリーズ）、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正（ピクセル-マイクロメートル変換）、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
PAM（Portable Arbitrary Map）は、Netpbmのメンテナーであるが2000年頃にNetpbmファミリーに追加したラスター画像フォーマットで、オリジナルのPBM、PGM、PPMフォーマットを統一し拡張する汎化として設計されました。従来のNetpbmフォーマットがそれぞれ特定の画像タイプを処理する（PBMは二値、PGMはグレースケール、PPMはカラー）のに対し、PAMは柔軟なASCIIヘッダーを通じてチャンネル、ビット深度、画像タイプの任意の組み合わせを表現できる単一のフォーマットを提供します。PAMヘッダーはキーワード-値ペアを使用します。WIDTH、HEIGHT、DEPTH（チャンネル数）、MAXVAL（最大サンプル値、最大65535）、TUPLTYPE（画像タイプを識別する文字列 — BLACKANDWHITE、GRAYSCALE、RGB、GRAYSCALE_ALPHA、RGB_ALPHA、またはカスタムタイプ）。ヘッダーの後、ピクセルデータはバイナリで格納され、各サンプルはMAXVALに応じて1バイトまたは2バイトを占めます。PAMの前身に対する重要なイノベーションは、ネイティブのアルファチャンネルサポートです。GRAYSCALE_ALPHA（2チャンネル）およびRGB_ALPHA（4チャンネル）タプルタイプは、オリジナルのPBM/PGM/PPMフォーマットでは表現できなかった透過を、別のマスクファイルなしで提供します。PAMの利点の一つはフォーマットの統一です。単一のPAM読み取り実装がモノクロ、グレースケール、カラー、およびアルファ付き画像を処理でき、各Netpbmバリアント用の個別パーサーが不要になります。拡張可能なTUPLTYPEメカニズムもまた実用的な強みです — カスタムチャンネル構成（マルチスペクトル、デプス+カラー、その他のアプリケーション固有の配置）をフォーマット仕様を変更することなく表現しラベル付けできます。PAMはNetpbmツール、ImageMagick、GIMP、およびNetpbmファミリーを処理するプログラミングライブラリでサポートされています。