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フォーマットについて
IPL(IPLab)は、Scanalytics(後にBD Biosciencesに買収)が開発した科学画像フォーマットで、1988年頃に最初にリリースされたIPLab科学画像解析ソフトウェア向けに設計されました。このフォーマットは、生物学および生物医学研究における定量分析に必要な精度とメタデータを備えた顕微鏡および科学イメージングデータの格納を目的としていました。IPLファイルは8ビットおよび16ビット符号なし整数、16ビット符号付き整数、32ビット浮動小数点ピクセル値を含む複数のデータ型をサポートし、蛍光顕微鏡、CCDカメラ、およびその他の科学イメージング機器が生成する広いダイナミックレンジに対応します。このフォーマットはZスタック(試料を通過する焦点シリーズ)、タイムラプスシーケンス、各チャンネルが異なる蛍光プローブからの発光を捉えるマルチチャンネル蛍光取得を含む多次元データセットを扱います。IPLファイルには画像寸法、データ型、プレーン数、空間校正(ピクセル-マイクロメートル変換)、顕微鏡システムからの取得メタデータを含むヘッダーが含まれています。IPLの利点の一つは定量的完全性です。ガンマ補正、圧縮、または色空間変換を適用する写真フォーマットとは異なり、IPLは検出器からの生の線形強度値を保持するため、画像データに対して行われる蛍光強度、光学密度、粒子数の測定が測定されている物理量に直接対応することが保証されます。顕微鏡コミュニティにおける役割もまた実用的な考慮事項です。IPLabは1990年代から2000年代にかけて細胞生物学、神経科学、病理学の研究室で広く使用されており、公開された研究のアーカイブIPLデータセットは科学的に貴重な価値を持ち続けています。IPLファイルはImageJ/FIJI、Bio-Formats、ImageMagickで読み取ることができます。
XBM(X BitMap)は、1987年頃にMITでX Window Systemの一部として定義されたモノクロ(1ビット)画像フォーマットです。XBMファイルは画像フォーマットの中で唯一有効なCソースコードであるという点でユニークです。各ファイルは画像の幅、高さ、およびオプションのホットスポット座標(カーソル画像用)を指定する#defineステートメントに続いて、パックされたピクセルデータを含むstatic unsigned char値の配列として画像を定義します。ピクセルデータは波括弧内の16進バイト値として格納され、各ビットが1ピクセルを表し(1 = 前景、0 = 背景)、各バイト内でLSBファーストの順序です。この設計は意図的でした — XBM画像はX Windowアプリケーションのソースコードに直接#includeしてバイナリにコンパイルでき、外部ファイルの読み込みやランタイムでのフォーマット解析が不要になります。このフォーマットはX11エコシステム全体でカーソル形状、ウィンドウアイコン、ツールバーボタン、その他の小さなUI要素に使用されていました。XBMの利点の一つはフォーマットのソースコード性です。XBMファイルはテキストエディタで編集でき、バージョン管理でdiffおよびマージ可能で、シェルスクリプトで生成でき、画像読み込みライブラリなしにCプログラムに直接コンパイルできます — バイナリ画像フォーマットでは実現できないレベルのツールチェーン統合です。X Windowの標準の一部としての役割により、すべてのX11対応ツールキットおよびアプリケーションに理解されることが保証されています。モノクロのみで圧縮はありませんが、XBMのシンプルさはビットマップ表現の理解のための優れた教育用フォーマットとなっています。XBMファイルはすべてのX11アプリケーション、ImageMagick、GIMP、ウェブブラウザ(レガシーウェブフォーマットとして)、プログラミング環境でサポートされています。