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Informazioni sui formati
IPL (IPLab) è un formato immagine scientifico sviluppato da Scanalytics (successivamente acquisita da BD Biosciences) per il loro software di analisi di immagini scientifiche IPLab, rilasciato per la prima volta intorno al 1988. Il formato è stato progettato per memorizzare dati di microscopia e imaging scientifico con la precisione e i metadati necessari per l'analisi quantitativa nella ricerca biologica e biomedica. I file IPL supportano diversi tipi di dati, inclusi interi a 8 e 16 bit senza segno, interi a 16 bit con segno e valori pixel in virgola mobile a 32 bit, adattandosi alle ampie gamme dinamiche prodotte da microscopi a fluorescenza, telecamere CCD e altri strumenti di imaging scientifico. Il formato gestisce dataset multidimensionali, tra cui Z-stack (serie focali attraverso un campione), sequenze time-lapse e acquisizioni a fluorescenza multicanale dove ogni canale cattura l'emissione di una diversa sonda fluorescente. I file IPL includono un'intestazione con le dimensioni dell'immagine, il tipo di dati, il numero di piani, la calibrazione spaziale (conversione pixel-micrometri) e i metadati di acquisizione dal sistema microscopico. Un vantaggio è l'integrità quantitativa: a differenza dei formati fotografici che applicano correzione gamma, compressione o trasformazioni dello spazio colore, IPL preserva i valori di intensità lineari grezzi dal rilevatore, assicurando che le misurazioni dell'intensità di fluorescenza, della densità ottica o del conteggio delle particelle eseguite sui dati immagine corrispondano direttamente alle grandezze fisiche misurate. Il ruolo del formato nella comunità della microscopia rappresenta un'altra considerazione pratica: IPLab è stato ampiamente usato nei laboratori di biologia cellulare, neuroscienza e patologia durante gli anni '90 e 2000, e i dataset IPL archiviati da ricerche pubblicate mantengono il loro valore scientifico. I file IPL possono essere letti da ImageJ/FIJI, Bio-Formats e ImageMagick.
PGM (Portable Graymap) è il membro per le immagini in scala di grigi della famiglia di formati Netpbm, creato da Jef Poskanzer nel 1988 come parte del toolkit Pbmplus per sistemi Unix. PGM memorizza immagini a singolo canale d'intensità dove ogni pixel contiene un valore grigio da 0 (nero) a un massimo specificato dall'utente (tipicamente 255 per 8 bit o 65535 per 16 bit). Il formato esiste in versione ASCII (numero magico P2), dove i valori dei pixel sono scritti come numeri decimali in testo separati da spazi, e binario (numero magico P5), dove i valori sono memorizzati come byte grezzi. Entrambe le varianti iniziano con un'intestazione che specifica numero magico, larghezza, altezza e valore massimo di grigio. PGM è stato progettato come intermedio per le scale di grigi nella filosofia di pipeline converti-elabora-converti di Netpbm: le immagini sorgente di qualsiasi formato vengono convertite in PGM, elaborate usando l'ampia libreria di strumenti a riga di comando di Netpbm, poi convertite nel formato di destinazione. Un vantaggio è la trasparenza del formato — la variante ASCII rende i dati dell'immagine leggibili direttamente dall'uomo e facilmente elaborabili con strumenti testuali come awk e grep, inestimabile per il debug e la didattica. L'adozione da parte della comunità scientifica e della visione artificiale è un altro punto di forza: la semplice rappresentazione a singolo canale di PGM lo rende un formato naturale per gli algoritmi di analisi delle immagini, e molti articoli accademici e materiali didattici usano esempi PGM. Il formato è supportato da ImageMagick, GIMP e innumerevoli librerie di elaborazione immagini.