Conversor IPL a SGI

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Sobre los formatos

IPL (IPLab) es un formato de imagen científica desarrollado por Scanalytics (posteriormente adquirida por BD Biosciences) para su software de análisis de imágenes científicas IPLab, publicado por primera vez alrededor de 1988. El formato fue diseñado para almacenar datos de microscopía e imagen científica con la precisión y los metadatos necesarios para el análisis cuantitativo en investigación biológica y biomédica. Los archivos IPL admiten múltiples tipos de datos incluyendo enteros de 8 y 16 bits sin signo, enteros de 16 bits con signo y valores de píxeles de punto flotante de 32 bits, acomodando los amplios rangos dinámicos producidos por microscopios de fluorescencia, cámaras CCD y otros instrumentos de imagen científica. El formato maneja conjuntos de datos multidimensionales incluyendo pilas Z (series focales a través de una muestra), secuencias de time-lapse y adquisiciones de fluorescencia multicanal dónde cada canal captura la emisión de una sonda fluorescente diferente. Los archivos IPL incluyen un encabezado con dimensiones de imagen, tipo de datos, número de planos, calibración espacial (conversión de píxeles a micrómetros) y metadatos de adquisición del sistema de microscopio. Una ventaja es la integridad cuantitativa: a diferencia de los formatos fotográficos qué aplican corrección gamma, compresión o transformaciones de espacio de color, IPL preserva los valores de intensidad lineales sin procesar del detector, asegurando qué las mediciones de intensidad de fluorescencia, densidad óptica o recuento de partículas realizadas sobre los datos de imagen correspondan directamente a las cantidades físicas qué se miden. El papel del formato en la comunidad de microscopía es otra consideración práctica: IPLab fue ampliamente utilizado en laboratorios de biología celular, neurociencia y patología durante los años 90 y 2000, y los conjuntos de datos IPL archivados de investigaciones publicadas siguen siendo científicamente valiosos. Los archivos IPL pueden leerse con ImageJ/FIJI, Bio-Formats e ImageMagick.
Desarrollador: Scanalytics
Lanzamiento inicial: 1988
SGI es la extensión de archivo genérica para el formato de Imagen de Silicon Graphics, también conocido por extensiones específicas de canal: .rgb (3 canales), .rgba (4 canales), .bw (escala de grises) e .int/.inta (variantes de 16 bits). Desarrollado por Silicon Graphics alrededor de 1986 para su sistema operativo IRIX, el formato SGI utiliza un encabezado de 512 bytes seguido de datos de imagen planares, dónde cada canal de color se almacena como un plano completo en lugar de estar entrelazado con otros canales en cada píxel. El encabezado específica un número mágico (474), modo de compresión (0 para literal, 1 para RLE), bytes por canal (1 o 2), dimensionalidad (1 para línea de escaneo, 2 para imagen, 3 para imagen multicanal), dimensiones de canal, rango de valores de píxeles y un nombre de imagen de 80 caracteres. Para imágenes comprimidas con RLE, una tabla de offsets y longitudes sigue al encabezado, permitiendo acceso aleatorio a líneas de escaneo individuales sin descompresión secuencial. Las estaciones de trabajo Silicon Graphics fueron la columna vertebral de los efectos visuales de Hollywood, la visualización científica, la simulación de vuelo y las industrias CAD/CAM durante los años 90, y el formato SGI era el formato de trabajo estándar en estos ámbitos. Una ventaja es el diseño robusto del formato: la combinación de compresión RLE direccionable por línea de escaneo, soporte multicanal, capacidad de 16 bits y disposición planar lo hacía igualmente adecuado para vista previa rápida y salida de renderizado de producción. La asociación del formato con la era dorada de los efectos visuales impulsados por SGI constituye otro aspecto notable — los archivos SGI de está época representan activos de producción de películas emblemáticas y visualizaciones científicas pioneras. Las imágenes SGI son compatibles con ImageMagick, GIMP, XnView, Photoshop (mediante plugin) y diversas aplicaciones de renderizado y composición 3D.
Desarrollador: Silicon Graphics
Lanzamiento inicial: 1986