Conversor IPL a JBG
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Sobre los formatos
IPL (IPLab) es un formato de imagen científica desarrollado por Scanalytics (posteriormente adquirida por BD Biosciences) para su software de análisis de imágenes científicas IPLab, publicado por primera vez alrededor de 1988. El formato fue diseñado para almacenar datos de microscopía e imagen científica con la precisión y los metadatos necesarios para el análisis cuantitativo en investigación biológica y biomédica. Los archivos IPL admiten múltiples tipos de datos incluyendo enteros de 8 y 16 bits sin signo, enteros de 16 bits con signo y valores de píxeles de punto flotante de 32 bits, acomodando los amplios rangos dinámicos producidos por microscopios de fluorescencia, cámaras CCD y otros instrumentos de imagen científica. El formato maneja conjuntos de datos multidimensionales incluyendo pilas Z (series focales a través de una muestra), secuencias de time-lapse y adquisiciones de fluorescencia multicanal dónde cada canal captura la emisión de una sonda fluorescente diferente. Los archivos IPL incluyen un encabezado con dimensiones de imagen, tipo de datos, número de planos, calibración espacial (conversión de píxeles a micrómetros) y metadatos de adquisición del sistema de microscopio. Una ventaja es la integridad cuantitativa: a diferencia de los formatos fotográficos qué aplican corrección gamma, compresión o transformaciones de espacio de color, IPL preserva los valores de intensidad lineales sin procesar del detector, asegurando qué las mediciones de intensidad de fluorescencia, densidad óptica o recuento de partículas realizadas sobre los datos de imagen correspondan directamente a las cantidades físicas qué se miden. El papel del formato en la comunidad de microscopía es otra consideración práctica: IPLab fue ampliamente utilizado en laboratorios de biología celular, neurociencia y patología durante los años 90 y 2000, y los conjuntos de datos IPL archivados de investigaciones publicadas siguen siendo científicamente valiosos. Los archivos IPL pueden leerse con ImageJ/FIJI, Bio-Formats e ImageMagick.
JBG es una extensión de archivo para imágenes comprimidas usando el estándar JBIG (Joint Bi-level Image experts Group), formalmente la Recomendación T.82 de la UIT-T, completada en 1993 como sucesora de los estándares de compresión de fax Grupo 3 y Grupo 4. La compresión JBIG está diseñada para imágenes binivel (blanco y negro) pero también puede manejar imágenes en escala de grises y de color limitado codificando cada plano de bits por separado. El algoritmo utiliza una forma de codificación aritmética guiada por un modelo de contexto adaptativo: para cada píxel, el codificador examina una plantilla de píxeles circundantes ya codificados para construir una estimación de probabilidad, luego alimenta está estimación a un codificador QM (una variante del codificador aritmético Q-coder) qué produce una salida binaria altamente eficiente. JBIG logra un 20-40% mejor compresión qué el Grupo 4 en imágenes de documentos típicas, siendo la mejora incluso mayor en fotografías con mediotono y en imágenes con transiciones de densidad graduales dónde el simple enfoque de longitud de ejecución del Grupo 4 es menos efectivo. El estándar admite codificación progresiva, dónde una versión de baja resolución de la imagen se transmite primero y se refina progresivamente — útil para aplicaciones tipo fax dónde el receptor puede comenzar a mostrar la imagen antes de qué lleguen los datos de resolución completa. Una ventaja es la compresión superior de documentos qué contienen imágenes con mediotono: periódicos, revistas y materiales de marketing qué mezclan texto con mediotonos fotográficos se comprimen drásticamente mejor con JBIG qué con Grupo 3/4. El respaldo de la UIT-T del estándar garantiza qué esté implementado en hardware y software de imagen documental en todo el mundo. Los archivos JBG son compatibles con ImageMagick y diversas herramientas de imagen documental.