Конвертер IPL в PDB

IPL (IPLab) — формат научных изображений, разработанный компанией Scanalytics (впоследствии приобретенной BD Biosciences) для программы научного анализа изображений IPLab, впервые выпущенной около 1988 года. Формат предназначен для хранения данных микроскопии и научной визуализации с точностью и метаданными, необходимыми для количественного анализа в биологических и биомедицинских исследованиях. Файлы IPL поддерживают несколько типов данных: 8- и 16-битные беззнаковые целые, 16-битные знаковые целые и 32-битные значения с плавающей запятой, обеспечивая широкие динамические диапазоны, характерные для флуоресцентных микроскопов, ПЗС-камер и других научных приборов. Формат работает с многомерными наборами данных: Z-стеками (серии фокальных срезов), таймлапс-последовательностями и многоканальными флуоресцентными снимками, где каждый канал регистрирует излучение от отдельного флуоресцентного зонда. Файлы IPL содержат заголовок с размерами изображения, типом данных, количеством плоскостей, пространственной калибровкой (перевод пикселей в микрометры) и метаданными оборудования. Одно из преимуществ — количественная целостность: в отличие от фотографических форматов с гамма-коррекцией, сжатием или преобразованием цветовых пространств, IPL сохраняет исходные линейные значения интенсивности с детектора, гарантируя, что измерения флуоресценции, оптической плотности или подсчета частиц соответствуют реальным физическим величинам. Роль формата в сообществе микроскопистов — еще один практический аспект: IPLab широко применялся в лабораториях клеточной биологии, нейронаук и патологии в 1990-х и 2000-х годах. Файлы IPL читаются в ImageJ/FIJI, Bio-Formats и ImageMagick.