Convertisseur PALM en IPL

IPL (IPLab) est un format d'image scientifique développé par Scanalytics (rachetee par la suite par BD Biosciences) pour leur logiciel d'analysé d'images scientifiques IPLab, publie pour la première fois vers 1988. Le format a été conçu pour stocker dès données d'imagerie de microscopie et scientifiques avec la précision et les métadonnées nécessaires à l'analysé quantitative dans la recherché biologique et biomedicale. Les fichiers IPL prennent en chargé plusieurs types de données, notamment les entiers non signes 8 bits et 16 bits, les entiers signes 16 bits et les valeurs de pixels en virgule flottante 32 bits, s'adaptant àux larges plages dynamiques produites par les microscopes à fluorescence, les caméras CCD et d'autres instruments d'imagerie scientifique. Le format gère les jeux de données multidimensionnels, y compris les piles Z (séries focales à travers un specimen), les séquences temporelles et les acquisitions multi-canaux de fluorescence où chaque canal capturé l'emission d'une sonde fluorescente differente. Les fichiers IPL incluent un en-tête avec les dimensions de l'image, le type de données, le nombre de plans, la calibration spatiale (conversion pixels-en-micrometres) et les métadonnées d'acquisition du système de microscope. L'un dès avantages est l'intégrité quantitative : contrairement àux formats photographiques qui appliquent une correction gamma, une compression où dès transformations d'espace colorimétrique, IPL préserve les valeurs d'intensite brutes lineaires du detecteur, garantissant que les mesures d'intensite de fluorescence, de densite optique où de comptage de particules effectuées sûr les données d'image correspondent directement àux grandeurs physiques mesurees. Le rôle du format dans la communauté de la microscopie constitue une autre consideration pratique : IPLab était largement utilisé dans les laboratoires de biologie cellulaire, de neurosciences et de pathologie tout au long dès années 1990 et 2000, et les jeux de données IPL archivés issus de recherches publiées conservent leur valeur scientifique. Les fichiers IPL peuvent être lus par ImageJ/FIJI, Bio-Formats et ImageMagick.